A folha deitada é mais grave do que parece
Página digitalizada de lado é o defeito mais comum em processo escaneado, e o mais subestimado. Quem lê no computador pode girar a tela e seguir em frente, mas o documento fica assim para sempre no processo, e quem imprimir vai receber a folha atravessada.
A ferramenta soma o giro que você pede ao giro que a página já trazia, em vez de substituí-lo. Isso importa porque um scanner decente já grava a correção dentro do arquivo, e uma ferramenta que ignora esse valor desfaz o acerto que já existia.
Remover página exige mais cuidado do que reordenar
Reordenar é reversível e visível: se a ordem ficou errada, você percebe ao ler. Remover não: uma folha descartada por engano só aparece quando alguém procura por ela, às vezes meses depois, e a essa altura o documento já está no processo.
Por isso a remoção aqui é sempre desfazível antes de gerar o arquivo, e as páginas removidas ficam guardadas na sessão. Ainda assim, confira o documento final antes de protocolar: a conferência continua sendo de quem protocola.
Numeração original e ordem nova
Se o documento já traz numeração impressa, reordenar as páginas faz os números saírem fora de sequência. Isso não é defeito da ferramenta: é consequência de mexer na ordem de algo que já foi paginado.
Quando a peça vai ser protocolada com nova paginação, o caminho é organizar primeiro e numerar depois, para que a numeração acompanhe a ordem final.
O que esta ferramenta não faz
Não faz reconhecimento de texto: se o PDF veio de um scanner, cada página continua sendo uma imagem depois de organizada. Não assina digitalmente, e reorganizar um documento assinado invalida a assinatura. Não corrige inclinação nem melhora o contraste da digitalização. Não protocola por você. E não substitui a conferência final: o responsável pelo protocolo continua sendo quem confere.