PDF/A é PDF feito para durar
PDF/A é uma variante do PDF pensada para arquivamento de longo prazo. A ideia é que o documento continue sendo exibido daqui a décadas exatamente como hoje, sem depender de nada que esteja fora dele.
Daí vêm as regras: todas as fontes precisam estar embutidas no arquivo, as cores precisam de um perfil declarado, e o documento não pode conter criptografia, JavaScript ou conteúdo que dependa de programa externo. Um PDF comum quebra qualquer uma dessas condições sem que ninguém perceba.
Órgãos que exigem PDF/A o fazem por causa de arquivamento: o processo administrativo tem prazo de guarda longo, e um documento que deixa de abrir corretamente daqui a quinze anos é um problema jurídico, não apenas técnico.